Статья

Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020

E. Alm, E. Broberg, T. Connor, E. Hodcroft, A. Komissarov, S. Maurer-Stroh, A. Melidou, R. Neher, Á. O'Toole, D. Pereyaslov, N. Beerenwinkel, S. Posada-Céspedes, K. Jablonski, P. Ferreira, I. Topolsky, T. Avšič-Županc, M. Korva, M. Poljak, S. Zakotnik, T. Zorec, K. Bragstad, O. Hungnes, K. Stene-Johansen, C. Reusken, A. Meijer, H. Vennema, L. Ruiz-Roldán, M. Bracho, N. García-González, Á. Chiner-Oms, I. Cancino-Muñoz, I. Comas, G. Goig, M. Torres-Puente, M. López, L. Martínez-Priego, G. D'Auria, P. Ruíz-Hueso, L. Ferrús-Abad, G. de Marco, I. Galan-Vendrell, S. Carbó-Ramirez, P. Ruiz-Rodriguez, M. Coscollá, K. Polackova, L. Kramna, O. Cinek, J. Richter, G. Krashias, C. Tryfonos, S. Bashiardes, D. Koptides, C. Christodoulou, B. Bartolini, C. Gruber, A. Di Caro, C. Castilletti, F. Stefani, S. Rimoldi, F. Romeri, F. Salerno, S. Polesello, A. Nagy, H. Jirincova, J. Vecerova, L. Novakova, S. Cordey, M. Murtskhvaladze, N. Kotaria, T. Schär, C. Beisel, O. Vugrek, F. Rokić, L. Trgovec-Greif, I. Jurak, T. Rukavina, N. Sučić, K. Schønning, S. Karst, R. Kirkegaard, T. Michaelsen, E. Sørensen, S. Knutson, J. Brandt, V. Le-Quy, T. Sørensen, C. Petersen, M. Pedersen, S. Larsen, M. Skov, M. Rasmussen, J. Fonager, A. Fomsgaard, R. Maksyutov, E. Gavrilova, O. Pyankov, S. Bodnev, T. Tregubchak, A. Shvalov, D. Antonets,
2020

We show the distribution of severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) genetic clades over time and between countries and outline potential genomic surveillance objectives. We applied three genomic nomenclature systems to all sequence data from the World Health Organization European Region available until 10 July 2020. We highlight the importance of real-time sequencing and data dissemination in a pandemic situation, compare the nomenclatures and lay a foundation for future European genomic surveillance of SARS-CoV-2.

Цитирование

Похожие публикации

Источник

Версии

  • 1. Version of Record от 2020-01-01

Метаданные

Об авторах
  • E. Alm
    European Centre for Disease Prevention and Control
  • E. Broberg
    European Centre for Disease Prevention and Control
  • T. Connor
    Public Health Wales, College of Biomedical and Life Sciences
  • E. Hodcroft
    Biozentrum, Universität Basel
  • A. Komissarov
    Smorodintsev Research Institute of Influenza
  • S. Maurer-Stroh
    A-Star, Bioinformatics Institute, National University of Singapore, Ministry of Health, Government of Singapore, Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID)
  • A. Melidou
    European Centre for Disease Prevention and Control
  • R. Neher
    Biozentrum, Universität Basel
  • Á. O'Toole
    The University of Edinburgh
  • D. Pereyaslov
    WHO Regional Office for Europe
  • N. Beerenwinkel
  • S. Posada-Céspedes
  • K. Jablonski
  • P. Ferreira
  • I. Topolsky
  • T. Avšič-Županc
  • M. Korva
  • M. Poljak
  • S. Zakotnik
  • T. Zorec
  • K. Bragstad
  • O. Hungnes
  • K. Stene-Johansen
  • C. Reusken
  • A. Meijer
  • H. Vennema
  • L. Ruiz-Roldán
  • M. Bracho
  • N. García-González
  • Á. Chiner-Oms
  • I. Cancino-Muñoz
  • I. Comas
  • G. Goig
  • M. Torres-Puente
  • M. López
  • L. Martínez-Priego
  • G. D'Auria
  • P. Ruíz-Hueso
  • L. Ferrús-Abad
  • G. de Marco
  • I. Galan-Vendrell
  • S. Carbó-Ramirez
  • P. Ruiz-Rodriguez
  • M. Coscollá
  • K. Polackova
  • L. Kramna
  • O. Cinek
  • J. Richter
  • G. Krashias
  • C. Tryfonos
  • S. Bashiardes
  • D. Koptides
  • C. Christodoulou
  • B. Bartolini
  • C. Gruber
  • A. Di Caro
  • C. Castilletti
  • F. Stefani
  • S. Rimoldi
  • F. Romeri
  • F. Salerno
  • S. Polesello
  • A. Nagy
  • H. Jirincova
  • J. Vecerova
  • L. Novakova
  • S. Cordey
  • M. Murtskhvaladze
  • N. Kotaria
  • T. Schär
  • C. Beisel
  • O. Vugrek
  • F. Rokić
  • L. Trgovec-Greif
  • I. Jurak
  • T. Rukavina
  • N. Sučić
  • K. Schønning
  • S. Karst
  • R. Kirkegaard
  • T. Michaelsen
  • E. Sørensen
  • S. Knutson
  • J. Brandt
  • V. Le-Quy
  • T. Sørensen
  • C. Petersen
  • M. Pedersen
  • S. Larsen
  • M. Skov
  • M. Rasmussen
  • J. Fonager
  • A. Fomsgaard
  • R. Maksyutov
  • E. Gavrilova
  • O. Pyankov
  • S. Bodnev
  • T. Tregubchak
  • A. Shvalov
  • D. Antonets
Название журнала
  • Eurosurveillance
Том
  • 25
Выпуск
  • 32
Номер гранта
  • undefined
Тип документа
  • journal article
Тип лицензии Creative Commons
  • CC BY
Правовой статус документа
  • Свободная лицензия
Источник
  • scopus