Patterns of the SARS-CoV-2 epidemic spread in a megacity

Цель исследования - изучить закономерности, свойственные эпидемическому процессу COVID-19, в условиях мегаполиса, в фазах подъёма, стабилизации и снижения заболеваемости, а также оценить эффективность противоэпидемических мероприятий. Материал и методы. Проведено комплексное изучение распространения SARS-CoV-2 в Москве с использованием эпидемиологического, молекулярно-генетического и статистического методов исследования в период пандемии COVID-19. Результаты и обсуждение. Показано, что применение максимально жёстких организационно-ограничительных мер в масштабах Москвы, обеспечивающих разрыв механизма передачи SARS-CoV-2, и высокая дисциплина населения по исполнению режима самоизоляции позволили не допустить экспоненциального роста заболеваемости COVID-19. Анализ динамики выявления новых случаев COVID-19 показал, что эффект от применения мер по разобщению и режима самоизоляции в условиях мегаполиса наступает через временной промежуток, равный 3,5 инкубационного периода, при его максимальной длительности 14 дней. Установлено, что показатель частоты определения РНК SARS-CoV-2 среди условно здорового населения и его динамика - важные параметры мониторинга, особенно на фазах роста и стабилизации заболеваемости COVID-19, позволяющие в перспективе 1-2 инкубационных периодов (14-28 дней) прогнозировать развитие эпидемиологической ситуации. Общий коэффициент летальности, рассчитанный за период наблюдения (06.03.2020-23.06.2020) в Москве, составил 1,73%. Заключение. В результате проведённого эпидемиологического анализа ситуации с COVID-19 в Москве определены некоторые закономерности распространения SARS-CoV-2 и оценена эффективность противоэпидемических мероприятий, направленных на разрыв механизма передачи возбудителя.

Цитирование

Список литературы

1. Lu R., Zhao X., Li J., Niu P., Yang B., Wu H., et al. Genomic characterization and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020; 395(10224): 565-74. DOI: http://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8

2. Romagnani P., Gnone G., Guzzi F., Negrini S., Guastalla A., Annun-ziato F., et al. The COVID-19 infection: lessons from the Italian experience. J. Public Health Policy. 2020; 41(3): 238-44. DOI: http://doi.org/10.1057/s41271-020-00229-y

3. Sebastiani G., Massa M., Riboli E. Covid-19 epidemic in Italy: evolution, projections and impact of government measures. Eur. J. Epidemiol. 2020; 35(4): 341-5. DOI: http://doi.org/10.1007/s10654-020-00631-6

4. Rothe C., Schunk M., Sothmann P., Bretzel G., Froeschl G., Wallrauch C., at al. Transmission of 2019-nCoV infection from an asymptomatic contact in Germany. N. Engl. J. Med. 2020; 382(10): 970-1. DOI: http://doi.org/10.1056/NEJMc200146

5. Holshue M.L., DeBolt C., Lindquist S., Lofy K.H., Wiesman J., Bruce H., et al. First case of 2019 novel coronavirus in the United States. N. Engl. J. Med. 2020; 382(10): 929-36. DOI: http://doi.org/10.1056/NEJMoa2001191

6. WHO. Coronavirus disease 2019 (COVID-19) Situation Report - 51. Available at: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200311-sitrep-51-covid-19.pdf

7. Беляков В.Д., Дегтярев А.А., Иванников Ю.Г. Качество и эффективность противоэпидемических мероприятий. Л.: Медицина; 1981.

8. Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Шипулина О.Ю., Яцышина С.Б., Ти-ванова Е.В., Каленская А.В. и др. Эпидемиологическое значение определения РНК SARS-CoV-2 среди различных групп населения Москвы и Московской области в период эпидемии COVID-19. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020; 97(3): 197-201. DOI: http://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-3-197-201

9. Lauer S.A., Grantz K.H., Bi Q., Jones F.K., Zheng Q., Meredith H.R., et al. The incubation period of coronavirus disease 2019 (Covid-19) from publicly reported confirmed cases: estimation and application. Ann. Intern. Med. 2020; 172(9): 577-82. DOI: http://doi.org/10.7326/ M20-0504

10. Backer J.A., Klinkenberg D., Wallinga J. Incubation period of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) infections among travelers from Wuhan, China, 20-28 January 2020. Euro Surveill. 2020; 25(5) : 2000062. DOI: http://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.5.2000062

11. Liu T., Hu J., Kang M., Lin L., Zhong H., Xiao J., et al. Transmission dynamics of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV). J. Med. Virol. 2020; 92(5): 501-11. DOI: http://doi.org/10.1101/2020.01.25.919787

12. Read J.M., Bridgen J.R.E., Cummings D.A.T., Ho A., Jewell C.P. Novel coronavirus 2019-nCoV: early estimation of epidemiological parameters and epidemic predictions. medRxiv. 2020. DOI: http://doi.org/10.1101/2020.01.23.20018549

13. Riou J., Althaus C.L. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019 novel coronavirus (2019-nCoV), December 2019 to January 2020. Euro Surveill. 2020; 25(4): 2000058. DOI: http://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25A2000058.

14. Shen M., Peng Z., Xiao Y., Zhang L. Modelling the epidemic trend of the 2019 novel coronavirus outbreak in China. bioRxiv. 2020. DOI: http://doi.org/10.1101/2020.01.23.916726

15. Wu J.T., Leung K., Leung G.M. Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of the 2019-nCoV outbreak originating in Wuhan, China: a modelling study. Lancet. 2020; 395(10225): 689-97. DOI: http://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30260-9

16. Randolph H.E., Barreiro L.B. Herd Immunity: Understanding COVID-19. Immunity. 2020; 52(5): 737-41. DOI: http://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.04.012

17. Verity R., Okell L.C., Dorigatti I., Winskill P., Whittaker C., Imai N., et al. Estimates of the severity of coronavirus disease 2019: a model-based analysis. Lancet Infect. Dis. 2020; 20(6): 669-77. DOI: http://doi.org/10.1016/S1473

18. Wu J.T., Leung K., Bushman M., Kishore N., Niehus R., de Salazar P.M., et al. Estimating clinical severity of COVID-19 from the transmission dynamics in Wuhan, China. Nat. Med. 2020; 26(4): 506-10. DOI: http://doi.org/10.1038/s41591-020-0822-7-3099(20)30243-7

19. Puca E., Civljak R., Arapovic J., Popescu C., Christova I., Raka L., et al. Short epidemiological overview of the current situation on Covid-19 pandemic in Southeast European (SEE) countries. J. Infect. Dev. Ctries. 2020; 14(5): 433-7. DOI: http://doi.org/10.3855/jidc.12814

20. Abdollahi E., Champredon D., Langley J.M., Galvani A.P., Moghadas S.M. Temporal estimates of case-fatality rate for COVID-19 outbreaks in Canada and the United States. CMAJ. 2020; 192(25): E666-70. DOI: http://doi.org/10.1503/cmaj.200711

21. Xu S., Li Y. Beware of the second wave of COVID-19. Lancet. 2020; 395(10233): 1321-2. DOI: http://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30845-X

22. de Brouwer R., van Veldhuisen D.J., de Boer R.A. Surviving the first COVID-19 wave and learning lessons for the second. Eur. J. Heart Fail. 2020; 22(6): 975-7. DOI: http://doi.org/10.1002/ejhf.1938

23. Vogel L. Is Canada ready for the second wave of COVID-19? CMAJ. 2020; 192(24): E664-5. DOI: http://doi.org/10.1503/cmaj.1095875

24. Ceylan Z. Estimation of COVID-19 Prevalence in Italy, Spain, and France. Sci. Total Environ. 2020; 729: 138817. DOI: http://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.138817

25. Li Q., Guan X., Wu P., Wang X., Zhou L., Tong Y., et al. Early transmission dynamics in Wuhan, China, of novel coronavirus-infected pneumonia. N. Engl. J. Med. 2020; 382(13): 1199-207. DOI: http://doi.org/10.1056/NEJMoa2001316

26. Chatterjee A., Gerdes M.W., Martinez S.G. Statistical Explorations and Univariate timeseries analysis on COVID-19 datasets to understand the trend of disease spreading and death. Sensors (Basel). 2020; 20(11): 3089. DOI: http://doi.org/10.3390/s20113089

27. Abdollahi E., Champredon D., Langley J.M., Galvani A.P., Moghadas S.M. Temporal estimates of case-fatality rate for COVID-19 outbreaks in Canada and the United States. CMAJ. 2020; 192(25): E666-70. DOI: http://doi.org/10.1503/cmaj.200711

28. Львов Д.К., Альховский С.В. Истоки пандемии COVID-19: экология и генетика коронавирусов (Betacoronavirus: Coronaviridae) SARS-CoV, SARS-CoV-2 (подрод Sarbecovirus), MERS-CoV (подрод Merbecovirus). Вопросы вирусологии. 2020; 65(2): 62-70. DOI: http://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-2-62-70

Источник

Версии

1. Version of Record от 2020-09-02

Метаданные

Об авторах

Акимкин В. Г.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Кузин С. Н.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Семененко Т. А.
ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почётного академика Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России
Шипулина О. Ю.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Яцышина С. Б.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Тиванова Е. В.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Каленская А. В.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Соловьёва И. В.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Вершинина М. А.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Квасова О. А.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Плоскирева А. А.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Мамошина М. В.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Елькина М. А.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Клушкина В. В.
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Андреева Е. Е.
Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по г. Москве
Иваненко А. В.
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в городе Москве»

Предметная рубрика

COVID-19

Название журнала

Problems of Virology

Страницы

203-211

Тип документа

journal article

Тип лицензии Creative Commons

CC BY

Правовой статус документа

Свободная лицензия

Источник

elpub

Поиск по репозиторию

Статья

Закономерности эпидемического распространения SARS-CoV-2 в условиях мегаполиса

Похожие публикации

Источник

Версии

Метаданные