Molecular genetic analysis SARS-CoV-2 of asymptomatic patients in Rostov region

Перевезенцев О. А.; Холодная Т. О.; Новикова Е. А.; Самсонов А. Е.; Бурцев Д. В.

Статья

Молекулярно-генетический анализ SARS-CoV-2 бессимтомных пациентов Ростовской области

Перевезенцев О. А., Холодная Т. О., Новикова Е. А., Самсонов А. Е., Бурцев Д. В.,

2020

https://doi.org/10.21886/2219-8075-2020-11-3-48-53

Цель: провести молекулярно-генетическую диагностику SARS-CoV-2 у бессимптомных индивидуумов Ростовской области. Материал и методы: было обследовано 22037 индивидуумов, которые на момент сдачи материала не имели клинически выраженных симптомов респираторного заболевания COVID-19. Молекулрно-генетическая диагностика SARS-CoV-2 проводилась методами RT-PCR и изотерической амплификации с ручным и автоматическим выделением вирусной РНК. Результаты: положительный результат был выявлен у 297 индивидуумов, подтверждён результат региональным референсным центром у 149 человек (0.68 %). Среди общей выборки было обследовано 3090 «контактных» пациентов (положительный результат — в 78 случаях (2.52 %)), 8109 медицинских работников (положительный результат – в 23 случаях (0.28 %)) и 3098 «контактных» медработников (положительный результат — в 24 случаях (0.77 %)). Выводы: применение молекулярно-генетического тестирования SARS-CoV-2 для выявления асимптомных случаев имеет серьёзные ограничения, поэтому для данной диагностической задачи необходима разработка альтернативных методов лабораторной диагностики, основанной на особенностях этиопатогенеза новой коронавирусной инфекции.

Цитирование

Список литературы

1. Paoli D, Pallotti F, Colangelo S, Basilico F, Mazzuti L, Turriziani O, et al. Study of SARS-CoV-2 in semen and urine samples of a volunteer with positive naso-pharyngeal swab. // J Endocrinol Invest. – 2020. – V.23. – P.1–4. https://doi.org/10.1007/s40618-020-01261-1

2. Ashour HM, Elkhatib WF, Rahman MM, Elshabrawy HA. Insights into the Recent 2019 Novel Coronavirus (SARSCoV-2) in Light of Past Human Coronavirus Outbreaks. // Pathogens. – 2020. – V.9(3). – P.186. https://doi.org/10.3390/pathogens9030186

3. Cascella M, Rajnik M, Cuomo A, Dulebohn SC, Di Napoli R. Features, Evaluation, and Treatment of Coronavirus (COVID-19) [Updated 2020 Aug 10]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2020 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK554776/

4. Chen Y, Guo Y, Pan Y, Zhao ZJ. Structure analysis of the receptor binding of 2019-nCoV. // Biochemical and Biophysical Research Communications. – 2020. – V.525, Is.1. – P. 135-140. https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2020.02.071.

5. Corman VM, Landt O, Kaiser M, Molenkamp R, Meijer A, Chu DK, et al. Detection of 2019 novel coronavirus (2019- nCoV) by real-time RT-PCR. // Euro Surveill. – 2020. – V.25(3). -2000045. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045.

6. Xie C, Jiang L, Huang G, Pu H, Gong B, Lin H, et al. Comparison of different samples for 2019 novel coronavirus detection by nucleic acid amplification tests. // Int J Infect Dis. – 2020. – V.93. – P.264-267. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.02.050.

7. Peng X, Xu X, Li Y, Cheng L, Zhou X, Ren B. Transmission routes of 2019-nCoV and controls in dental practice. // International Journal of Oral Science. – 2020. – V.12(1). https://doi.org/10.1038/s41368-020-0075-9

8. Cheng MP, Papenburg J, Desjardins M, Kanjilal S, Quach C, Libman M, et al. Diagnostic Testing for Severe Acute Respiratory Syndrome–Related Coronavirus-2. A Narrative Review. // Ann Intern Med. – 2020. – V. 172(11). – P. 726-734. https://doi.org/10.7326/M20-1301.

9. Wang W, Xu Y, Gao R, Lu R, Han K, et al. Detection of SARSCoV-2 in Different Types of Clinical Specimens. // JAMA. – 2020. – V. 323(18). – P.1843–4. https://doi.org/10.1001/jama.2020.3786.

10. Huang WE, Lim B, Hsu C, Xiong D, Wu W, Yu Y, et al. RTLAMP for rapid diagnosis of coronavirus SARS‐CoV‐2. // Microbial Biotechnology. – 2020. – V.13(4). – P. 950-961. https://doi.org/10.1111/1751-7915.13586

11. Lai CC, Liu YH, Wang CY, Wang YH, Hsueh SC, et al. Asymptomatic carrier state, acute respiratory disease, and pneumonia due to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2): Facts and myths. // J Microbiol Immunol Infect. – 2020. – V.53(3). – P.404-412. https://doi.org/10.1016/j.jmii.2020.02.012

12. Zou L, Ruan F, Huang M, Liang L, Huang H, et al. SARSCoV-2 Viral Load in Upper Respiratory Specimens of Infected Patients. N // Engl J Med. – 2020. – V. 382(12). – P.1177- 1179. https://doi.org/10.1056/NEJMc2001737.

13. Lippi G, Sanchis-Gomar F, Henry BM. Coronavirus disease 2019 (COVID-19): the portrait of a perfect storm. // Annals of Translational Medicine. – 2020. – V.8(7). – P.497–497. https://doi.org/10.21037/atm.2020.03.157

14. Guo L, Ren L, Yang S, Xiao M, Chang D, et al. Profiling Early Humoral Response to Diagnose Novel Coronavirus Disease (COVID-19). // Clin Infect Dis. – 2020. – V. 71(15). – P. 778- 785. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa310.

15. Broughton JP, Deng X, Yu G, Fasching CL, Servellita V, Singh J, et al. CRISPR-Cas12-based detection of SARS-CoV-2. // Nat Biotechnol. – 2020. – V. 38(7). – P. 870-874. https://doi.org/10.1038/s41587-020-0513-4.

16. Бурцев Д.В., Аванян Н.Л., Кипайкин В.А., Скрипец Н.В. О системе эпидемиологической безопасности в областном консультативно-диагностическом центре. // Инфекция и иммунитет. - 2017. - № S. - С. 113. eLIBRARY ID: 35379622

Источник

Версии

1. Version of Record от 2020-06-19

Метаданные

Об авторах

Перевезенцев О. А.
Ростовский Государственный Медицинский Университет; Областной консультативно-диагностический центр
Холодная Т. О.
Ростовский Государственный Медицинский Университет; Областной консультативно-диагностический центр
Новикова Е. А.
Ростовский Государственный Медицинский Университет; Областной консультативно-диагностический центр
Самсонов А. Е.
Ростовский Государственный Медицинский Университет; Областной консультативно-диагностический центр
Бурцев Д. В.
Ростовский Государственный Медицинский Университет; Областной консультативно-диагностический центр

Предметная рубрика

COVID-19

Название журнала

Medical Herald of the South of Russia

Страницы

48-53

Тип документа

journal article

Тип лицензии Creative Commons

CC BY

Правовой статус документа

Свободная лицензия

Источник

elpub

Поиск по репозиторию

Статья

Молекулярно-генетический анализ SARS-CoV-2 бессимтомных пациентов Ростовской области

Похожие публикации

Источник

Версии

Метаданные