Features of Etiology of Community-Acquired Pneumonia Associated with COVID-19

Цель исследования – сравнительное изучение этиологической структуры внебольничных пневмоний у SARSCoV-2 «+» и SARS-CoV-2 «-» больных, обратившихся за помощью в медицинские организации Ростовской области. Материалы и методы. Исследовали биологический материал (мазки из носоглотки и мокроту) от 508 пациентов с диагнозом «внебольничная пневмония», находившихся на амбулаторном лечении или в стационарах г. Ростова-на-Дону. Верификация респираторных вирусов, включая РНК SARS-CoV-2, а также M. pneumoniae, C. pneumoniae, L. pneumophila выполнена методом полимеразной цепной реакции в мазках носоглотки (n=508). Бактериологический анализ мокроты проводили с использованием дифференциально-диагностических сред, идентификацию выделенных патогенов осуществляли с помощью времяпролетной масс-спектрометрии на приборе Autoflex (Bruker Daltonics, Германия) c программным обеспечением BioTyper 3,0. Результаты и обсуждение. В период распространения новой коронавирусной инфекции в Ростовской области основным этиологическим агентом внебольничных пневмоний является новый коронавирус SARS-CoV-2. Особенностью внебольничных пневмоний (ВП) у пациентов с лабораторно подтвержденным COVID-19 является более высокая частота микстинфекций как вирусной, так и бактериальной этиологии. На фоне выявления у пациентов с ВП РНК SARS-CoV-2 зарегистрированы случаи обнаружения коронавирусов других типов (HKU-1, OC43, HL-63 или 229Е). Наиболее часто этиологическим агентом ВП бактериальной природы являлись бактерии рода Streptococcus как у пациентов с ВП, ассоциированной с COVID-19, так и у пациентов с отрицательным результатом на SARS-CoV-2. Коронавирусные больные представляют группу высокого риска по развитию микотических поражений легких.

Цитирование

Список литературы

1. Чучалин А.Г., Синопальников А.И., Козлов Р.С., Авдеев С.Н., Тюрин И.Е., Руднов В.А., Рачина С.А., Фесенко О.В. Клинические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике тяжелой внебольничной пневмонии у взрослых. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2015; 17(2):84–126.

2. Рачина С.А., Бобылев А.А. Атипичные возбудители внебольничной пневмонии: от эпидемиологии к особенностям диагностики и лечения. Практическая пульмонология. 2016; 2:20–7.

3. Рачина С.А., Иванчик Н.В., Козлов Р.С. Особенности микробиологической диагностики при внебольничной пневмонии у взрослых. Практическая пульмонология. 2016; 4:40–7.

4. Du Toit A. Measles increases the risk of other infections. Nat. Rev. Microbiol. 2019; 18(1):2. DOI: 10.1038/s41579-019-0301-7.

5. Zahariadis G., Gooley T.A., Ryall P., Hutchinson C., Latchford M.I., Fearon M.A., Jamieson F.B., Richardson S., Kuschak T., Mederski B. Risk of ruling out severe acute respiratory syndrome by ruling in another diagnosis: variable incidence of atypical bacteria coinfection based on diagnostic assays. Can. Respir. J. 2006; 13(1):17–22. DOI: 10.1155/2006/862797.

6. Arabi Y.M., Al-Omari A., Mandourah Y., Al-Hameed F., Sindi A.A., Alraddadi B., Shalhoub S., Almotairi A., Al Khatib K., Abdulmomen A., Qushmaq I., Mady A., Solaiman O., Al-Aithan A.M., Al-Raddadi R., Ragab A., Al Mekhlafi G.A., Al Harthy A., Kharaba A., Ahmadi M.A., Sadat M., Mutairi H.A., Qasim E.A., Jose J., Nasim M., Al-Dawood A., Merson L., Fowler R., Hayden F.G., Balkhy H.H. Critically ill patients with the Middle East respiratory syndrome: a multicenter retrospective cohort study. Crit. Care Med. 2017; 45:1683–95. DOI: 10.1097/CCM.0000000000002621.

7. Zhou Y., Guo S., He Y., Zuo Q., Liu D., Xiao M., Fan J., Li X. COVID-19 is distinct from SARS-CoV-2-negative community-acquired pneumonia. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2020; 10:322. DOI: 10.3389/fcimb.2020.00322.

8. Lai C.-C., Wang C.-Y., Hsueh P.-R. Co-infections among patients with COVID-19: The need for combination therapy with non-anti-SARS-CoV-2 agents? J. Microbiol. Immunol. Infect. 2020; 53(4):505–12. DOI: 10.1016/j.jmii.2020.05.013.

9. Chen N., Zhou M., Dong X., Qu J., Gong F., Han Y., Qiu Y., Wang J., Liu Y., Wei Y., Xia J., Yu T., Zhang X., Zhang L. Epidemiological and clinical characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a descriptive study. Lancet. 2020; 395(10223):507–13. DOI: 10.1016/S0140-6736(20)30211-7.

10. Стулова М.В., Кудряшева И.А., Полунина О.С., Черенова Л.П., Аршба Т.Е., Лисина О.А., Казакова Е.А. Сравнительный клинико-лабораторный анализ COVID-19 ассоциированной пневмонии с внебольничной пневмонией бактериальной этиологии. Современные проблемы науки и образования. 2020; 3. DOI: 10.17513/spno.29905.

Источник

Версии

1. Version of Record от 2021-02-06

Метаданные

Об авторах

Попова А. Ю.
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия; Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования
Ежлова Е. Б.
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
Демина Ю. В.
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования
Носков А. К.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Ковалев Е. В.
Управление Роспотребнадзора по Ростовской области
Чемисова О. С.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Твердохлебова Т. И.
ФБУН «Ростовский научноисследовательский институт микробиологии и паразитологии»
Павлович Н. В.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Водопьянов С. О.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Цимбалистова М. В.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Гаевская Н. Е.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Воловикова С. Ф.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Стенина С. И.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Гудуева Е. Н.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Сагакянц М. М.
ФКУЗ «Ростовский-на-Дону научно-исследовательский противочумный институт»
Алешукина А. В.
ФБУН «Ростовский научноисследовательский институт микробиологии и паразитологии»
Слись С. С.
Управление Роспотребнадзора по Ростовской области

Предметная рубрика

COVID-19

Название журнала

Problems of Particularly Dangerous Infections

Страницы

99-105

Тип документа

journal article

Тип лицензии Creative Commons

CC BY

Правовой статус документа

Свободная лицензия

Источник

elpub

Поиск по репозиторию

Статья

Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19

Похожие публикации

Источник

Версии

Метаданные