Введение: Появление и стремительное распространение COVID-19 стало серьёзным испытанием для систем здравоохранения всех стран. Целью исследования было выявление областей пространственной кластеризации случаев COVID-19 в течение первых трех месяцев от начала эпидемии на территории крупного города с населением более 1 млн человек (на примере г.Омска). Материалы и методы: Материалом исследования послужили данные эпидемиологических расследований случаев COVID-19, подтверждённых методом ПЦР на территории г. Омска за период с начала регистрации заболевания до 1 июля 2020 года. Создавали теплокарты с Епанечниковым ядром, рассчитывали общий индекс Гетиса-Орда (Gi*). Анализ геоданных проводили в приложении QGIS 3.14 Pi (qgis.org) с использованием плагина Visualist. Результаты: Визуальное исследование пространственного распределения случаев COVID-19 на конец анализируемого периода позволяет выделить нескольких зон с повышенной концентрацией, совпадающих с расположением медицинских организаций. В первую очередь распространение COVID-19 охватывало Советский, Центральный и Кировский районы, а вовлечение Ленинского и Октябрьского административного районов произошло спустя короткое время. Выводы: установлено неравномерное распределение случаев новой коронавирусной инфекции по территории Омска: выявлены тринадцать статистически значимых кластеров во всех административных районах города. Включение оперативной оценки пространственного распределения имеет огромный потенциал в планировании противоэпидемических мероприятий и является достаточно простой операцией, которая может быть выполнена в реальном времени.