PT - JOURNAL ARTICLE
AU - Жанна Сергеевна Тюлько, 
AU - Валерий Викторович Якименко, 
TI - Анализ использования кодонов в кодирующих последовательностях подсемейства Coronavirinae.
DP - 2020-11-30
SO - https://covid19.neicon.ru/publication/10370
AB - Проведены анализ и сравнение особенностей использования синонимичных кодонов у вирусов подсемейства Coronavirinae родов Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus, Deltacoronavirus, в том числе у вирусов SARS-CoV-2 в открытых рамках считывания ORF1ab и ORF2. Для всех изучаемых кодирующих последовательностей рассчитывались показатели относительного использования синонимичных кодонов которые в дальнейшем использовались при проведении дискриминантного анализа для выявления характерных особенностей каждой изучаемой группы последовательностей. В результате были выявлены достоверные различия в использовании синонимичных кодонов, как разными родами, так и отдельными видами коронавирусов причем SARS-CoV-2 значительно дистанцируется от большинства других бетакоронавирусов. Показано, также, что коронавирусы летучих мышей и птиц, часто занимают промежуточное положение по отношению к видам, относящимся к разным родам коронавирусов.